โครงการระยะที่ ๑ ปรับพื้นที่ ปลูกต้นไม้ และผลิตสมุนไพร และระบบสาธารณูปโภคบางส่วนเป็นพื้นที่เกษตรกรรมและสวนป่า ประกอบด้วย:- พื้นที่เกษตรกรรม และสวนป่า พื้นที่ปลูกพืชสมุนไพรเพื่อการผลิตวัตถุดิบและการวิจัย สำหรับการทดลองคุณภาพของสารสำคัญในพืชสมุนไพร ได้แก่ แปลงปลูกพืชสวนสมุนไพร เรือนเพาะชำ พื้นที่ขยายพันธุ์พืช อาคารเก็บวัสดุอุปกรณ์การเกษตร ที่จอดรถ บ้านพักเจ้าหน้าที่/คนงาน สระน้ำ สำหรับน้ำใช้ในการเพาะปลูก เป็นต้น

    โครงการระยะที่ ๒ สร้างศูนย์วิจัยและพัฒนา และการแปรรูปผลิตภัณฑ์สมุนไพร ซึ่งประกอบด้วย การจัดสร้างอาคารสิ่งก่อสร้าง ดังนี้
    - อาคารพิพิธภัณฑ์สมุนไพรแห่งชาติ (๑ ชั้น) พื้นที่ใช้สอย ๑๘๙๖ ตารางเมตร ใช้งบประมาณดำเนินการประมาณ ๔๒,๐๐๐,๐๐๐ บาท
    - อาคารวิจัยและพัฒนาสมุนไพร (๑ ชั้น) พื้นที่ใช้สอย ๑๒๐๐ ตารางเมตร ประกอบด้วย แสดง/จำหน่ายสินค้า
และเก็บสต็อกสินค้าสำเร็จรูป ใช้งบประมาณดำเนินการประมาณ ๓๐,๐๐๐,๐๐๐ บาท
    - อาคารพัฒนาวัตถุดิบสมุนไพร (๑ ชั้น) พื้นที่ใช้สอย ๖๘๗ ตารางเมตร ประกอบด้วย วิจัยพัฒนาเทคโนโลยีชีวภาพ/เวชศาสตร์ และผลิต/แปรรูปสมุนไพร ระดับอุตสาหกรรม ใช้งบประมาณดำเนินการประมาณ ๑๕,๒๕๕,๐๐๐ บาท
    - อาคารเตรียมวัตถุดิบสมุนไพร (๑ ชั้น) พื้นที่ใช้สอย ๑๐๘๒ ตารางเมตร ใช้งบประมาณดำเนินการประมาณ ๒๔,๐๗๕,๐๐๐ บาท
    - อาคารบ้านพักเจ้าหน้าที่ ๓ ชั้น ๒ หลัง ใช้งบประมาณดำเนินการประมาณ ๑๔,๐๐๐,๐๐๐ บาท
    - ทางเชื่อมระหว่างอาคาร พื้นที่ใช้สอย ๑๒๕ ตารางเมตร ใช้งบประมาณดำเนินการประมาณ ๒,๕๐๐,๐๐๐ บาท
    - ถนนที่จอดรถเฉพาะที่โครงการ พื้นที่ใช้สอย ๓๔๖๖ ตารางเมตร ใช้งบประมาณดำเนินการประมาณ
๒,๕๘๔,๐๐๐ บาท

     โครงการระยะที่ ๓ สร้างศูนย์แพทย์แผนไทย ซึ่งเป็นส่วนฟื้นฟูและสุขภาพบำบัด ประกอบด้วย
     - อาคารแพทย์แผนไทย กำหนดรูปแบบทางสถาปัตยกรรมเป็นอาคารเรือนไทยภาคอีสาน เพื่อให้สอดคล้องกับสภาพพื้นที่ถิ่นภูมิปัญญาไทย บริเวณทางเข้าอาคารมีบริเวณพื้นที่จอดรถ รับ-ส่ง ส่วนต้อนรับ การให้การรักษาและการตรวจวินิจฉัยโดยแพทย์ จัดให้มีทางเดินเชื่อมไปสู่ทางเข้า ส่วนบริการแพทย์แผนไทย เช่น การนวดไทย การประคบสมุนไพร การอบสมุนไพร เป็นต้น
     - อาคารบริการสุขภาพแพทย์ทางเลือก เป็นพื้นที่รองรับให้บริการทางการแพทย์แผนไทย กำหนดอยู่บริเวณเชื่อมต่อจากศูนย์แพทย์แผนไทย เป็นการสร้างรายได้ให้กับโครงการ เพื่อการพึ่งพาตนเอง ประกอบด้วย เรือนรับรองสุขภาพ (Nursing home) อาคารบ้านพัก-รีสอร์ท อาคารส่วนบริการ บ้านพักเจ้าหน้าที่/คนงาน สระน้ำ สำหรับน้ำใช้ในการ เพาะปลูก และสามารถสร้างบรรยากาศให้สดชื่นได้ด้วยสมุนไพรไม้หอม เป็นต้น
     - ครัวไทยสุขภาพ เป็นพื้นที่บริการ เรื่อง ของอาหารที่ประยุกต์ใช้ภูมิปัญญาไทย เป็นหลัก เช่น อาหารไทย ผลไม้ไทย เครื่องดื่มจากพืชสมุนไพรไทย ที่มีสรรพคุณตามหลักโภชนาการ ใช้เป็นสถานที่สาธิตและแลกเปลี่ยนความรู้ของชุมชนได้อีกด้วย
     - ศูนย์ฝึกนวดไทย เป็นส่วนรองรับบุคคลทั่วไป เพื่อฝึกปฏิบัติการเรียนการสอน การฝึกอบรมทักษะสุขภาพบำบัด เช่น การนวดไทยชนิดต่าง ๆ ด้วยมุ่งหวังการผลิตบุคลากรได้ใช้ความรู้เพื่อประกอบวิชาชีพและพึ่งตนเองได้
     - สวนฤาษีดัดตนและพื้นที่ส่งเสริมสุขภาพ เป็นพื้นที่ที่ต้องการความสงบ จัดให้มีศาลาส่วนแสดงของกิจกรรมพื้นที่ภายในศูนย์แพทย์แผนไทย ในด้าน Meditation ในสถานบริการ จัดพื้นที่สำหรับ การสวดมนต์ ทำสมาธิ วิปัสสนาปฏิบัติธรรมและกายบริหารฤาษีดัดตน มีผลเพื่อการบำบัดรักษาโรค เช่น แก้โรคลมทั่วสรรพางค์กาย แก้เมื่อย แก้ปวด และการฝึกโยคะ หมายถึง การเชื่อมต่อผสมผสานฝึกจิตวิญญาณ จิตใจ ร่างกาย เป็นต้น
     - บำบัดน้ำเสีย พื้นที่วางระบบกระบวนการทำหรือที่ปรับปรุงน้ำเสียให้มีคุณภาพเป็นน้ำทิ้งที่มีคุณภาพมาตรฐานที่กำหนด อยู่ในบริเวณบริการทางการแพทย์แผนไทย โดยคำนึงถึงระบบระบายน้ำและระบบบำบัดน้ำเสียก่อนที่จะระบายลงลงสู่แหล่งรองรับน้ำทิ้งต่อไป
     - บ้านพักเจ้าหน้าที่/คนงาน เฉพาะการแพทย์แผนไทย ที่ต้องเตรียมเครื่องมือ/อุปกรณ์สำหรับให้บริการทางการแพทย์
     - สระน้ำ สำหรับน้ำใช้ในการดูแลรักษางานภูมิทัศน์ และสามารถสร้างบรรยากาศให้สดชื่นได้เป็นอย่างดี

โครงการระยะที่ ๔ สร้างศูนย์การเรียนรู้สวนสมุนไพร ซึ่งประกอบด้วย
     - อาคารพิพิธภัณฑ์และฝึกอบรม กำหนดให้เป็นหน่วยงานอำนวยการของโครงการ เพื่อการจัดการงานบริหาร และส่วนแสดงสื่อการอนุรักษ์ ส่วนที่เกี่ยวข้องกับสมุนไพรพื้นที่ของส่วนต้อนรับ ประชาสัมพันธ์ ห้องบรรยาย ห้องประชุมและสัมมนา ส่วนบริการ ร้านขายของที่ระลึก เป็นต้น
     - กลุ่มพืชตามอาการโรค พื้นที่สวนสมุนไพรเพื่อการบำบัดรักษา (Healing landscape) รวบรวมพืชสมุนไพร
รวม ไม้ยืนต้น ไม้พุ่ม ไม้คลุมดิน และไม้เลื้อย จัดการแบ่งกลุ่มตามอาการรักษา ทำให้สะดวกกับผู้เข้าชมและง่ายต่อการจดจำเป็นหมวดหมู่
     - สมุนไพรความงาม แปลงปลูกพืชสมุนไพรอยู่บริเวณส่วนหน้า เป็นกลุ่มพืชที่นำมาใช้และเป็นที่นิยมมาใช้เป็น
เครื่องสำอาง ซึ่งมีหลายชนิดด้านความสวยความงาม บำรุงเส้นผม รักษาผิวพรรณ เช่น มะขาม (Tamarindus indica Linn.) ว่านหางจระเข้ (Aloevera (L.)Burm.f.) แตงกวา (Cucumis sativus Linn) งา (Sesamum indicum L.) เป็นต้น
      - สมุนไพรน้ำมันหอมระเหย เป็นกลุ่มพืชสมุนไพรหลายชนิดที่นำมาสกัดน้ำมันหอมระเหย ซึ่งจะได้กลิ่นที่
แตกต่างกัน เช่น การเวก (Artabotys siamesis Miq) เตยหอม (Pandanus amaryllifolius Roxb.) ดอกมะลิ (Jasminum Sambac (L.) Aiton) ดอกกุหลาบมอญ (Rosa x damascena Mill.) พิกุล (Mimusops elengi L.) แก้ว (Murraya paniculata (L.) Jack.) ไพล มีสรรพคุณ ไล่แมลง รักษาผิวหนังอักเสบ ฆ่าเชื้อโรค เป็นต้น
      - หมู่บ้านอีสานใต้ กำหนดเป็นหมู่บ้านตัวอย่างที่รวบรวมพื้นที่เขตอีสานใต้ ซึ่งเป็นบริเวณที่อุดมไปด้วยแหล่ง
ของพืช โดยเฉพาะพืชสมุนไพรที่มีคุณค่าทางยา ปรากฏในตำรายาพื้นบ้านอีสานเป็นจำนวนมาก ควรค่าแก่การอนุรักษ์ ภูมิปัญญาไทย เผยแพร่และฟื้นฟูให้คงอยู่สืบไป จัดให้มีลานบ้านอยู่ตรงกลาง ล้อมรอบด้วยบ้านแต่ละจังหวัด ประกอบด้วย นครราชสีมา บุรีรัมย์ สุรินทร์ ยโสธร อำนาจเจริญ ศรีสะเกษ และอุบลราชธานี จัดแสดงวิถีชีวิตความเป็นอยู่กลุ่มบ้านเรือนไทยภาคตะวันออกเฉียงเหนือ สะท้อนความสัมพันธ์ครอบครัว รวมทั้งแสดงการถ่ายทอดเทคโนโลยีจากภูมิปัญญาของชาวอีสาน เพื่อการศึกษาวิจัย และเพื่อการใช้ประโยชน์ที่ปลอดภัยต่อประชาชน
โครงการระยะที่ ๕ สร้างส่วนบริการ ประกอบด้วย พื้นที่บริการอื่น ๆ เช่น บ้านพักสำหรับการบำบัดรักษา (Nursing Home) พื้นที่จอดรถ (สำรอง) ลานอเนกประสงค์ ส่งเสริมกิจกรรมการท่องเที่ยวเชิงสุขภาพ ซึ่งประกอบด้วย ป้อมยาม พื้นที่จอดรถบัส ที่จอดรถ ลานน้ำพุ ลานจัดกิจกรรมกลางแจ้งและลานอเนกประสงค์ สระน้ำ บ่อบำบัดน้ำชีวภาพ ๑ บ่อบำบัดน้ำชีวภาพ ๒ บ่อบำบัดน้ำชีวภาพ ๓ อาคารซ่อมบำรุง บริเวณกำจัดขยะ